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ChIP（染色质免疫沉淀）方法是研究活体“蛋白质－DNA”相互反应的一种非常强大的工具。目前，这种方法用于染色质结构的动力学研究、转录因子的调节和辅助调节因子及其他表观遗传变化的研究。ChIP的使用过程分为三个主要步骤：第一步，在甲醛固定后分离和破碎染色质；第二步，使用感兴趣的蛋白的抗体完成特定染色质片段的免疫沉淀；第三步，分析免疫沉淀片段以确定出靶标DNA是否与感兴趣的蛋白结合。ChIP方法是一种复杂的、技术上要求高的过程，尤其是当对转录因子的抗体进行分析时：有多个需要优化的步骤，包括抗体的选择、用超声波剪切染色质的条件和免疫沉淀DNA的分析。Active Motif公司的ChIP-IT Kit完全地解决了所有这些与ChIP方法有关的潜在的问题。Active Motif ChIP-IT Kit含有ChIP分析的25个反应所需的所有试剂。另外，这种试剂盒还备有一个详细的指南――为实验方案的优化节约了时间。指南中的方案容易......阅读全文 ChIP实验的三大法宝 在基因调控领域，可以说没有比表观遗传学更热的话题了。而染色质免疫共沉淀ChIP是表观遗传学研究中最常用的方法。 ChIP通过针对染色质相关蛋白（组蛋白、转录因子等）的抗体，来鉴定与该蛋白（或蛋白修饰）相连的序列。这种方式能够帮助人们定位基因组中发生的表观遗传学改变。举例来说，针对H3K4 如何利用CRISPR-dCas9来研究基因调控 顺式调控元件（TRE）和反式调控元件（CRE）一直是人们感兴趣的对象，通常利用染色质免疫沉淀（ChIP）和染色质捕获技术来研究。不过，德克萨斯大学西南医学中心的研究人员最近开发出一种新方法，结合CRISPR的靶定能力以及生物素-链霉亲和素的互作优势来鉴定TRE和CRE。 这种名为CAPTURE 染色质免疫共沉淀技术（ChIP） 真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细 用CRISPR 突破ChIP-seq的局限 生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞在转录因子的控制下表达不同的基因，从而实现特异性的功能。比如说，神经细胞表达的基因有助于向其他神经细胞传递信息，而免疫细胞表达的基因有助于它们合成抗体。 将染色质免疫共沉淀技术与下一代高通量测序技术相结合的染色质免疫共沉淀测序（ChI Science：梳理患儿肿瘤细胞的基因组寻求答案 组蛋白翻译后修饰方式出现异常，以及组蛋白修饰位置出现异常都会导致肿瘤发生。 高通量DNA测序技术的快速扩张让我们能够以前所未有的速度和精细度对人体疾病展开遗传学分析，尤其是对罕见的小儿疾病进行全基因组测序(whole-genome sequencing)更是有助于我们对儿童发育，以及多 揭秘m6A修饰新功能 －－ 调控染色质状态和转录活性 文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院 揭秘m6A修饰新功能 －－ 调控染色质状态和转录活性 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所 染色质免疫共沉淀技术（ChIP） 真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, CHIP）是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细 Nature Methods：高质量的组蛋白PTM抗体 美国芝加哥大学的研究人员开发出质量稳定的重组抗体，能特异识别组蛋白H3的三甲基赖氨酸残基，适合各种表观遗传学应用。这一成果于近日发表在《Nature Methods》在线版上。 组蛋白的翻译后修饰(PTM)在表观遗传调控中发挥重要作用。组蛋白PTM的抗体是表观遗传学研究(如染色质免疫沉 科学家开发出高质量的组蛋白PTM抗体 美国芝加哥大学的研究人员开发出质量稳定的重组抗体，能特异识别组蛋白H3的三甲基赖氨酸残基，适合各种表观遗传学应用。这一成果于近日发表在《Nature Methods》在线版上。 组蛋白的翻译后修饰(PTM)在表观遗传调控中发挥重要作用。组蛋白PTM的抗体是表观遗传学研究(如染色质免疫沉 简化ChIP分析的新方法 最近，美国普渡大学的研究人员开发出一种方法，称为ZipChip，可大大降低ChIP分析的时间和成本，同时还能提高灵敏度。 染色质免疫沉淀（ChIP）研究，对于染色质相关蛋白和组蛋白修饰在基因组中的定位，提供了深入的见解。然而，标准的ChIP方法耗时、昂贵、费力，由于涉及大量的步骤，易受实验误差 Cell揭示癌症转移新机制 来自斯坦福大学医学院的研究人员揭示出，Nfib通过广泛提高染色质的可接近性促进了癌症转移。这一研究发现发布在6月30日的《细胞》（Cell）杂志上。 斯坦福大学医学院遗传系助理教授William J. Greenleaf，及遗传学系与病理学系助理教授Monte M. Winslow博士是这项研 复旦大学周峰团队Cell发文原位染色质互作网络相关研究 近日，德克萨斯州西南医学中心的徐剑教授课题组与复旦大学附属中山医院及生物医学研究院（IBS）周峰研究员课题组合作，首次利用了“biotinylated dCAS9”的方法建立了高分辨率，位点特异原位DNA-蛋白质以及其他元件的互作网络 。8月24日，相关研究成果以《通过dcas9原位捕捉染色质相 高通量测序的应用及前景 一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤，避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力，对照一个参比基因组（reference genome）高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序（re-sequence），2007年van Orsouw 高通量测序技术——第二代测序技术 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(de 高通量测序技术技术的应用及前景 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能, 所以又被称 高通量测序技术技术的应用及前景 高通量测序技术技术的应用及前景 （作者：生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜） 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划 高通量测序技术技术的应用及前景 高通量测序技术技术的应用及前景 （作者：生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜） 高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划 清华大学颉伟课题组12月接连发表Molecular Cell、PLOS Genet 生物通报道：来自清华大学生命科学学院的颉伟研究员，早年毕业于北京大学，2008年获美国加州大学洛杉矶分校博士学位，曾在加州大学洛杉矶分校、圣地亚哥Ludwig肿瘤研究所和加州大学圣地亚哥分校从事博士后研究，2013年起任清华大学生命科学学院研究员，主要科研领域与方向包括表观遗传学、基因组学和生物 再次飞跃 | 短短2天，中国学者连续发表11篇CNS 3.杨辉/李亦学/Lars M. Steinmetz等团队建立新型脱靶检测技术，基因编辑工具安全性评估或迎来新突破 CRISPR/Cas9是广泛关注的新一代基因编辑工具，自从2012年被发明以来，它一直以其高效性和特异性备受世人的期待，然而值得注意的是，CRISPR/Cas9从问世以来，其脱靶风险 circRNA再发IF=18.88高分文章--circRNA机制研究汇总 超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子，但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此，作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能，并探究了其调节心脏重塑的分子机制 circRNA再发IF=18.88高分文章--circRNA机制研究汇总 超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子，但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此，作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能，并探究了其调节心脏重塑的 转录分析的几种方法 信号通路，只有一个目的：将细胞的外部信号转换成细胞的内部变化。不管是胰岛素，还是异亮氨酸，抗原还是肾上腺素，它们的终极目的总是如出一则：对转录活性的改变。 这些对于转录活性的影响来自于转录因子与基因的调控区域：如启动子、增强子、沉默子等结合达到的。经典的凝胶迁移滞后试验（the electrop 染色质免疫沉淀芯片（Chip-Chip） 该技术能够快速在目标基因组的染色体中确定特异DNA结合蛋白的准确结合位点，ChIP芯片也可以在一个基因组的任何感兴趣的区域内寻找染色体的结构改变。一、ChIP-Chip的用途（1）在基因组范围内确定基因转录因子的DNA结合位点和其他DNA结合蛋白或蛋白复合体的DNA结合位点。（2）染色体活性状态的定 北大汤富酬、乔杰团队Cell Res表观遗传学新成果 生物通报道：2016年11月8日，国际著名期刊《Cell Research》在线发表了北京大学汤富酬、乔杰团队题为“DNA methylation and chromatin accessibility profiling of mouse and human fetal germ cells” 遗传发育所等在表观遗传调控水稻转座子活性方面获进展 转座元件是指在基因组中能够移动或复制并重新整合到基因组新位点的DNA片段，它们对动植物基因组的组成、进化和基因表达具有重要影响。而在宿主基因组中，如果失去对转座元件的有效抑制，这些元件将对基因表达和基因组的稳定性构成影响。水稻是主要的粮食作物同时也是重要的单子叶模式植物，其中 单细胞染色质图谱|揭示转录因子网络和细胞谱系关系 2019年10月8日，美国圣地亚哥的Salk研究所的Geoffrey Wahl团队在Cell Reports杂志上发表文章“Single-Cell Chromatin Analysis of Mammary Gland Development Reveals Cell-State Transcr 人类分娩启动机制研究获新突破 早产不仅是围产期新生儿死亡的主要原因，也直接影响到早产儿成年后的健康。目前人们尚缺乏防治早产的有效手段，主要原因在于人类分娩启动机制尚未完全阐明。在国家自然科学基金的资助下，复旦大学生命科学院教授孙刚领导的研究小组对这一科学问题进行了深入研究，为阐明人类分娩启动机制提供新的突破点。 清华Nature子刊发表表观遗传学新成果 生物通报道：高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体，形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质，使DNA受到良好的保护。通过“读取”模块识别组蛋白共价修饰是表观遗传学调控的一个主要机制。 最近人们发现了多种组蛋白赖氨酸酰化，比如巴豆酰化（Kcr）、丁酰化（Kbu 免疫组化实验原理和步骤（五） （6）结果判断免疫组化的结果判断有两种方法：一是对以检测结果阳性细胞指数来定性(如核抗原的标记)，判断方法是以一个规野中阳性细胞数不总细胞癿百分比，再取10个相同视野算取平均指数。另一种方法以染色阳性强度和阳性检出率相结合而定，一般阳性细胞数在0-25为阴性，25-50为十，50-75为十十，75以
Active Motif 公司是一家致力于研发和生产核细胞分子生物学和表观遗传学研究用试剂的专业公司，也是世界上最大的转录因子试剂生产商和 ChIP-seq 外包服务供应商。Active Motif 的产品涉及：表观遗传学相关抗体、Chip 级别抗体、重组识别子和催化酶、预甲基化修饰的重组组蛋白、多聚核小体和生物素标记核小体；以及各类染色质分析、转录因子表达调控分析和 DNA 甲基化分析的试剂盒等。不仅如此，Active Motif 还为研究者提供专业的表观遗传学服务，特别是 Chip-seq 的外包服务。公司总部位于美国加州，目前在欧洲，日本，中国设有分公司。产品销售范围覆盖全球 30 多个国家和地区
梅大爷：第一次做动物组织的CHIP实验，用ActiveMotif53008试剂盒，这个是针对细胞的，我用的方法是把0.3g组织样本剪碎，分离单细胞，再固定处理后，用COVARISM220超声破碎仪超声破碎，跑胶检测，胶孔里无蛋白残留，破碎的条带也是弥散的，有谁用过这个CHIP试剂盒，或做组织CHIP，能否交流下经验[
]864天前来自网页版点赞0|评论|收藏评论评论转发取消Active Motif 的产品涉及:表观遗传学相关抗体、Chip 级别抗体、重组识别子和催化酶、预甲基化修饰的重组组蛋白、多聚核小体和生物素标记核小体;以及各类染色质分析、转录因子...
2020年9月6日ChIP(染色质免疫沉淀)方法是研究活体“蛋白质-DNA”相互反应的一种非常强大的工具。目前,这种方法用于染色质结构的动力学研究、转录因子的调节和辅助调节因子及...