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Kapa biosystems罗氏凭借10多年的设计专业知识,很高兴推出KAPA目标浓缩产品组合。这些新的基于杂交的靶标富集探针可在新的 KAPA HyperExome *  或   使用新的在线开发工具HyperDesign *开发的自定义面板*中获得  

与SeqCap EZ探针相比,我们的KAPA Target Enrichment Portfolio探针和更新的HyperCap v3工作流程具有明显的优势和改进,包括:

  • 具有针对难于捕获序列的设计专长

  • 卓越的捕获均匀性,降低了测序成本/时间

  • 整个工作流程中出色的单一供应商支持



Kapa biosystems全基因组测序(WGS)的目的是在单个实验中确定生物体的完整DNA序列,包括对编码区和非编码区的全面了解。因此,WGS提供了染色体和线粒体DNA以及叶绿体DNA(植物中)的编码区和非编码区的全面图像。WGS可以检测所有类型的遗传变异,包括单核苷酸多态性(SNP),小的插入和缺失(indels)以及结构变异,例如易位和拷贝数变异(CNV)。 

 

在其他应用程序中,WGS研究使我们能够:

  • 与靶向测序方法相比,可以更深入地了解健康,疾病和祖先的基因组基础

  • 发现生物标记并了解药物遗传学

  • 执行基因组水平的比较分析,以识别同构,直系同源和水平基因转移事件 

  • 为农业上重要的动植物生成参考基因组,以协助育种

  • 支持生态和保护生物学

  • 了解疾病暴发和公共卫生

  • 确保食品安全

  • 了解抗生素耐药性

  • 研究微生物群及其在人类健康和疾病中的作用



Kapa biosystems表观遗传分析

基于阵列的方法和基于下一代测序(NGS)的方法都用于研究表观遗传修饰。有三种基于NGS的常见方法可用于表观遗传分析:甲基序列,ChIP序列和ATAC序列。

Methyl-seq   用单核苷酸分辨率研究基因组的甲基化状态。该方法采用亚硫酸氢盐处理,可将胞嘧啶残基转化为尿嘧啶,而甲基化残基则保持不变。已经开发了几种甲基序列策略,包括全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)和简化表示的亚硫酸氢盐测序(RRBS),这丰富了CpG岛。

ChIP-seq将染色质免疫沉淀(ChIP)与NGS结合使用,以鉴定整个基因组中与DNA相关的蛋白质的结合位点,通常用于绘制组蛋白修饰和转录因子。该方法依靠靶向抗体的选择来富集与特定蛋白质结合的目标DNA片段。

ATAC-seq是用于转座酶可及的染色质测序的一种测定方法,可确定染色质可及性的区域并绘制DNA结合蛋白的图谱,以鉴定活性启动子,增强子和其他顺式调控元件。该方法通过生成具有50,000个细胞的测序文库,已经改变了基因调控的分析方法。

由于表观遗传学分析通常涉及超低输入DNA,因此从有限的材料构建高质量文库至关重要。罗氏测序解决方案提供了许多用于表观遗传工作流程的目标富集,文库制备和优化文库质量的解决方案。SeqCap®Epi靶标富集试剂盒可通过单碱基分辨率富集用于DNA甲基化评估的靶标。的  KAPA HyperPrep套件  理想地适合于这两个芯片起和甲基SEQ应用,因为它使接头连接的文库和扩增低偏压的更高的产率。这意味着更高的文库多样性,更低的重复率和更统一的覆盖率,尤其是对于低输入样本而言。对于甲基序列研究,  KAPA HiFi Uracil + 由于对尿嘧啶残基具有耐受性,HotStart DNA聚合酶对于亚硫酸氢盐转化的文库的扩增至关重要。KAPA HiFi HotStart ReadyMix可用于扩增ATAC-seq和ChIP-seq库,从而改善序列覆盖范围并减少偏差。



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