蚂蚁淘企业库：Mb级DNA片段全自动纯化回收仪SageHLS正式发布

美国Sage Science公司是一家创新研发制造企业，一直致力于改善生命科学应用中样品制备过程碰到的各种问题。公司于2017年2月13号宣布推出一种新的应用平台SageHLS，可以直接从细菌、组织培养物、血液样品或其它细胞源中提取和纯化极大的DNA片段。SageHLS平台（图1）近期正在美国佛罗里达州Hollywood举办的的基因组生物学和技术进展（AGBT）会议上展出。

高分子量（High molecular weight, HMW）DNA或者大片段DNA是很多基因组应用匹配的最佳材料。但是，传统的样品准备过程无法将DNA片段长度处理到这些范围，因而削弱了科学家通过长读长和长范围测序、光学图谱、微滴式数字PCR以及单分子工具等技术获取最佳信息的能力。SageHLS平台（HLS为高分子量文库系统的缩写）可以将DNA纯化至50kb-2Mb的长度，为单倍型、结构变异和其它大的或连锁的基因组元件的研究提供了高质量的长片段DNA。

Sage Science的首席执行官 Todd Barbera说:“我们相信数百Kb或者Mb级别DNA片段获取技术的突破，能够促进科学家充分利用先进的基因组技术，揭示大型基因组元件影响疾病和其它表型的机制。”他表示，“SageHLS 平台纯化出的DNA长度是其它工具所无法实现的。”工作原理如下图

图2. SageHLS工作原理图（简要流程：1. 将收集好的细胞（红色圆点）加入到反应室，溶液室中加SDS。2. 通过电泳，SDS进入到反应室，裂解细胞并把蛋白电泳洗脱。从细胞中释放的DNA由于分子量很大，被困在反应室中，无法进入电泳通道。3.  将酶切反应液加入到反应室，与超高分子量基因组DNA反应，使其片段化。4. 加入SDS到溶液室, 纯化酶切后的DNA大片段。5. DNA大片段进入电泳通道，根据分子量大小被回收进右边回收孔。黄色表示SDS，红色（条带）表示细胞内蛋白，绿色表示核酸酶）

在测试中，医学研究机构的科学家们已经利用SageHLS设备提取到2Mb大小的DNA片段（如图3）。并用CRISPR / Cas9基因编辑系统进行了基因组片段的靶向纯化，产生的198 kb的目标片段由SageHLS洗脱回收得到（如图4）。目标片段接下来可通过美国BioNano光学图谱测序技术或者英国Oxford公司的Nanopore测序系统进一步分析，也可以用传统的脉冲场电泳进行长度和带型检测。



图3. 白细胞中提纯的高分子量DNA片段


图4. 从大肠杆菌E.Coli原生质体中提取的198kb DNA片段(使用CRISPR/cas9核酸酶处理）

对于大多数样品的纯化，SageHLS至少可以回收1μg的DNA，满足常规基因组应用需求。该设备的其它应用正在进一步开发中。
 
要了解有关该产品的更多信息，可以访问http://www.sagescience.com/products/sagehls/。
 
环亚生物科技有限公司是美国Sage公司中国区总代理商，一直关注测序相关设备在国内的引进和开发，致力于协助国内客户更好、更快完成测序样本的制备工作，实现更高效率、更轻松的工作流程。
公司网站：www.apgbio.com