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Nanodrop 2000在实验室的用途

一、产品应用

ND-2000是目前国内外实验室中使用最为广泛的一款微量分光光度计,其优越的性能、准确的结果赢得了广大用户的好评。

该产品可用于以下几个方面:

*紫外检测:常规紫外光波长下检测样品吸光值;

*核酸检测:可检测dsDNA、ssDNA、RNA等不同类型核酸的浓度及其在260nm、280nm处的吸光值;

*探针检测:检测荧光标记探针的吸光值,可用于去除未能标记探针的样品;

*细胞培养物检测:检测细胞培养物在600nm处的吸光值;

*蛋白检测:检测普通纯化后蛋白的浓度和280nm处的吸光值;

*蛋白标记检测:可检测被BCA、Bradford或Lowry标定的蛋白样品,自动画出标准曲线并计算出待测蛋白质浓度。

二、产品简介

Nanodrop2000超微量分光光度计是NanoDrop的最新产品,应用液体的表面张力特性,样品体积只需要0.5~2ul,在检测台上,经上下臂的接触拉出固定的光径达到快速、微量、高浓度、免石英管、免毛细管等耗材检测吸收值的优点。此产品设计受专利保护,并在全世界广受欢迎,其准确度与便利性让科学家得以更有效率进行各项研究。

NanoDrop2000使用高能量氙灯(pulsedxenonflashlamp)可提供190~840nm的全光谱检测,且不需要暖机,开机后立即使用。搭配高感度CCDarray检测器,检测吸收值可高达300Abs(dsDNA浓度2~15000ng/ul),大部分纯化后的核酸几乎都不需要稀释即可检测。

待测样品的均质性是NanoDrop2000的最高要求,一般核酸、蛋白质样品能在检测前以vortexmixer震匀为最佳,若无vortexmixer也应以Pipette吸放数次混匀。若担心genomicDNA可能因前述动作而断裂,则改以55?C加热约一分钟,使样品在侦测前呈现均匀状态,以确保2ul具有代表性。

检测时选择不同检测模式,可以得到最快速的结果:

●NucleicAcid?C吸收光谱、230nm,260nm,280nm吸收值(换算成10mm光径吸收值)、260/280ratio、260/230ratio及核酸浓度。

●UV-Vis?C190~840nm间所有波长的吸收值及光谱(以1mm光径吸收值呈现)。

●A280蛋白质定量法?C280nm吸收值(换算成10mm光径吸收值)、260/280ratio及蛋白质浓度。仅适用于纯化后的蛋白质,须具有已知的质量消光系数(massextinctioncoefficient)方可计算。

●BCA、Bradford及Lowry?C依不同呈色剂提供不同波长吸收值结果,自动画出标准曲线并计算Rsquare,待测蛋白质浓度。

*蛋白质检测模式目前提供BCA、Bradford及Lowry三种常见定量呈色剂,因呈色剂随时间会逐渐加深,使用前请详阅试剂说明书并制备不同浓度的标准品,在最佳时间内完成检测,以得到良好的标准曲线。每个标准曲线最多可有七个标准品,每个标准品最多可做五重复。

*测蛋白质时样品体积需使用2ul,每个样品检测后需以Kimwipes低尘擦拭纸(编号:34155)擦拭15~20回,以避免呈色剂与蛋白质的残留。

浓度范围:

样品种类

最低浓度

最高浓度

(超过时请稀释样品)

再现性(五重复以上)

核酸

2ng/ul

15000ng/ul(dsDNA)

12000ng/ul(RNA)

浓度范围在2-100ng/ul时,SD为±2ng/ul

浓度范围大于100ng/ul时,CV为±2%

纯BSA

0.10mg/ml

100mg/ml

浓度范围在0.05-10mg/ml时,SD为±0.10mg/ml

浓度大于10mg/ml时,CV为±2%

蛋白质,以BCA方式定量

0.2mg/ml

8.0mg/ml

CV:±2%(在可侦测的浓度范围内皆然)

蛋白质,以modifiedLowry方式定量

0.2mg/ml

4.0mg/ml

CV:±2%(在可侦测的浓度范围内皆然)

蛋白质,以Bradford方式定量

100ug/ml

8000ug/ml

浓度范围在100-500ug/ml时,SD为±25ug/ml

浓度大于500ug/ml时,CV为±5%

蛋白质,以MiniBradford方式定量

15ug/ml

100ug/ml

浓度范围在15-50ug/ml时,SD为±4ug/ml

浓度大于50ug/ml时,CV为±5%

三、技术参数:

1、波长范围:190-840nm;

2、波长精度:1nm;

3、分辨率:<1.8nm(FWHMatHg253.7nm);

4、其它:1mm光程长度(可自动调整到0.05mm);

5、检测下限:2ng/μl(dsDNA);

6、检测上限:15000ng/μl(dsDNA);

7、吸光率精确度:0.002absorbance(1mm光程);

8、吸光率准确性:2%(at0.76at257nm);

9、吸光率范围:0.02-300(相当于10mm光程);

10、核酸检测周期:<5s;

11、体积:14cm×20cm。

四、使用方法举例:

dsDNA:在主画面点选NucleicAcid,计算机与仪器自动完成联机。依照DNA所溶于之液体准备该溶液(务必确认DNA溶于二次水、TEbuffer或哪一组kit的elutionbuffer)取出1.5ul点在侦测台上,放下上臂后再按Blank。在右上方拉选SampleType选DNA-50,在SampleID位置输入样品名称,将样品混匀,取出1.5ul点在侦测台上,放下上臂后再按Measure。

五、结果整理:

NanoDrop2000软件在侦测一开始会询问档案欲存至何处,若未指定,则档案会存在上一个使用者的档案内。

六、注意事项:

1.侦测后立即使用拭镜纸(Kimwipe类)擦拭台面。先取一张将上下台面的液体吸走,再将此laboratorywipe吸过样品的面反折到内部,折迭四次后以单方向多次擦拭台面(DNA擦5次,Protein擦20次)。

2.同一滴液体只能做一次侦测,欲重复定量同一样品,请擦掉前一滴,重新取出一滴进行侦测。

3.基本上核酸样品可使用1~2ul做测量,随各液体体积特性之不同会有不同体积需求,原则上不超过2ul。并请使用2ulpipette避免体积不足导致液柱无法完整形成。唯蛋白质样品因呈色剂与蛋白质本身特性,务必使用2ul进行侦测。

4.当软件跳出错误讯息时,请详细阅读并依指示进行障碍排除。最常发生的情形是在侦测过程液柱并未正确形成,软件会出现以下讯息。可先用肉眼观察液柱是否未完整连接上下台面,或样品内有泡泡,将上臂拉起后,擦掉该滴样品,再重新进行侦测,必要时可将样品体积加大至2ul。

5.不可使用含有HydrofluoricAcid(HF)之腐蚀样品,其它无腐蚀性之液体皆可使用。



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