
1、研发背景
快速精准建库产品,您用对了吗?
DNA文库制备是高通量测序前期的核心环节,文库的产量与质量直接决定了测序数据的产量与质量。但目前市面上多数试剂盒的建库方法,耗时、昂贵且操作非常繁琐的。这些方法在性能方面也存在一定的缺陷:如仅适用于DNA量充足且品质较好的样本、InputDNA片段化不完全、常出现形成G尾、聚合物等副反应或测序文库表现出一定的偏好性等。这些情况显著降低了DNA文库的转化率,并且极大影响后续测序数据的覆盖度和准确度。
Yeasen MaxUp,您的高通量测序建库的首选! 翊圣生物根据现状,集中海内外高通量测序领域的优秀科研人员,历时数年,开发了HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®常规DNA建库试剂盒,从产品设计,产品原料选用,产品性能优化,产品性能验证,产品标准制定,到产品成型,产品规模化生产,每一步都在严苛的标准、精细的研究中,实现了产品品质的飞跃。
HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®在文库产量与质量方面表现卓越:DNA的文库构建步骤少、转化率高,相对进口同款品牌至少高出20%,使文库扩增循环数更低,显著降低了测序数据的冗余度和偏好性。在建库速度、简便性、性价比以及样本适用性方面,达到国际一流品质。
2、产品描述 HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®是针对Illumina®高通量测序平台专业开发设计的建库试剂盒。本试剂盒可将低至1ng的微量片段化DNA制备成适用于Illumina®测序平台的专用文库。该试剂盒精心优化的配方体系,使他广泛适用于各种DNA样本。试剂盒整合了多个酶反应步骤,提供简并、线性化的操作方案,显著提高DNA建库效率。
HieffNGSTM产品具有严格的生产工艺,保证提供的每批次产品都经过严格的质量控制和功能验证,最高程度保障产品优异性能与批间稳定性。
1)2.75小时高效建库
HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®整合了多个酶反应步骤,提供简并的、线性化的操作方案,将DNA建库时间缩短至2.75小时以内。

图1HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®相对进口品牌N*同类型产品,建库更快。
2)文库转化率高
文库转化率,即DNA片段转化为双端带特定接头DNA片段的效率,是衡量建库试剂盒效率的重要指标。文库转化率强烈影响文库的多样性和质量,文库转化率高在一定程度上意味着测序覆盖度更好。
图2HieffNGSTMMaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®相对进口品牌N同类型产品具有更高的文库转化率。
样本:片段化E.coligDNA。接头比例:按各款试剂盒中推荐的数值。测定方法:连接完整接头后,qPCR文库定量。
3)文库扩增循环数少
获得特定产量文库所需的PCR循环数,是衡量试剂盒建库效率的另一重要指标。PCR循环数不足,可能造成文库产量低;PCR循环数过高,又将导致文库偏好性增加、冗余度增加、嵌合产物增加、扩增突变积累等多种不良后果。在获得相同产量文库时,使用的PCR循环数越少,表示试剂盒的建库效率更高。
表1HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®相对进口品牌N*同类型产品具有更高的建库效率。
4)优异的文库质量
使用HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®对100ngE.coli gDNA建库,所得文库均为单一条带,正态分布,无杂峰,片段大小符合测序要求。
图3HieffNGSTMMaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®所建文库Agilent2100Bioanalyzer检测。
建库样本:片段化E.coli gDNA。双轮分选比例(Post-adapterLigation):0.6×/0.2×和0.55×/0.15×。
5)优秀的测序数据
测序数据是反映建库试剂盒性能的最重要指标。使用HieffNGSTMMaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®和N*Ultra品牌同类型产品用于大肠杆菌基因组DNA文库构建,并使用Illumina® Hiseq4000平台,以PE150模式进行测序。所得Q30、碱基质量,MappedReads以及Coverage等方面均与品牌N*Ultra同类型产品相当,表现优异。
表2大肠杆菌K12菌株基因组DNA测序数据统计。
InputDNA:100ng.IlluminaHiseq4000,PE150,referencegenome: Escherichiacolistr.K-12substr.MG1655.
| InputDNA(ng) | Numberofcyclesrequiredtogenerate | |||
| 100ng | 1000ng | |||
| YeasenMaxUp | 品牌N* | YeasenMaxUp | 品牌N* | |
| 500 | 0 | 1-2 | 3-4 | 3-4 |
| 100 | 3-4 | 5-7 | 7-8 | 8-9 |
| 50 | 6-7 | 7-9 | 8-9 | 11-13 |
| 10 | 9-10 | 11-13 | 12-13 | 14-16 |
| 1 | 12-14 | - | 16-17 | - |
3、产品应用:将1ng-1μg片段化DNA制备成适用于Illumina®测序平台的专用文库。 4、文献引用[1]HeadSR,KomoriHK,LaMereSA,etal.Libraryconstructionfornext-generationsequencing:overviewsandchallenges[J].Biotechniques,2014,56(2):61. 5、常见问题Q:该款试剂盒适用于哪些样本的建库?
图4100ng_Yeasen样品测序数据Fastqc报告(左:序列质量分布;右:碱基分布)。
6)最优的性价比
Yeasen致力于为您提供性价比最高的产品!!
图5HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®性价比更高。
[2]ParkinsonNJ,MaslauS,FerneyhoughB,etal.Preparationofhigh-qualitynext-generationsequencinglibrariesfrompicogramquantitiesoftargetDNA[J].Genomeresearch,2012,22(1):125-133.
[3] vanDijkEL,JaszczyszynY,ThermesC.Librarypreparationmethodsfornext-generationsequencing:tonedownthebias[J].Experimentalcellresearch,2014,322(1):12-20.
[4]WolfK,O'NeilD,SchroeerS,etal.Next‐GenerationSequencingLibraryPreparationfromFFPETissueSamples[J].CurrentProtocolsinMolecularBIOLOGy,2016:7.24.1-7.24.14.
[5] AponeL,LiuP,PanchapakesaV,etal.EnhancingclinicalutilityofNGSwithreducedbias,lowDNAinput,libraryconstruction[J].2016.
A:本试剂盒适用于所有样本的DNA建库。
Q:在使用该款试剂盒时,不同类型的样本的InputDNA量应为多少?
A:InputDNA特指投入末端修复/dA尾添加步骤中的DNA。下表列举了本试剂盒在常见应用中推荐的InputDNA量。
表1常见应用中推荐InputDNA量
| Product | CleanReads | CleanBase(G) | Q30(%) | MappedReads(%) | Coverage(%) | AverageDepth(X) |
| Yeasen | 6,970,936 | 1.069 | 92.86 | 92.25 | 97.21 | 187.34 |
| N*Ultra | 6,667,866 | 1.018 | 91.83 | 92.11 | 96.92 | 186.90 |
【注】:上表为使用高质量DNA时推荐的InputDNA量,当InputDNA质量较差或需要进行片段分选时,应适当上调使用量。
Q:文库制备过程中,是否需要片段长度分选? 6、订购信息
A:文库制备过程中需要进行片段长度分选。分选步骤可选择在末端修复/dA尾添加之前,或在接头连接之后,或在文库扩增之后进行。当InputDNA质量≥50ng,您可选择在接头连接后分选;如InputDNA质量<50ng,建议您在文库扩增后进行分选。
Q:使用该款试剂盒所得的文库是否可以用于IonTorrent平台?
A:本款试剂盒针对Illumina®平台开发,所得文库仅适用于Illumina®平台。
Q:产品的有效期与保存方法?
A:产品所有组分-20°C保存,有效期1年。
Q:纯化和分选步骤,可以使用哪些磁珠?
A:纯化和分选步骤,建议使用HieffNGSTM DNASelectionBeads(Cat#12601)或AMPureXPBeads(Cat#A63880)或其他等效产品。
| 应用 | 样本类型 | 推荐InputDNA量 |
| 全基因组测序 | 复杂基因组 | 50ng-1μg |
| 靶向捕获测序 | 复杂基因组 | 10ng-1μg |
| 全基因组测序,靶向捕获测序 | FFPEDNA | ≥50ng |
| 全基因组测序,靶向捕获测序 | cfDNA/ctDNA | ≥1ng |
| 全基因组测序 | 微生物基因组 | 1ng-1μg |
| 免疫共沉淀测序 | ChIP-DNA | ≥1ng |
| 靶向测序 | 扩增子 | ≥1ng |
7、相关产品推荐测序文库制备,您还可能用到
| 产品 | 货号 | 规格 | 价格(元) |
| HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina | 12201ES08 | 8libraries | 1726.00 |
| 12201ES24 | 24libraries | 4626.00 | |
| 12201ES96 | 96libraries | 16626.00 |
更多产品信息请拨打:4000-520-616或登陆:https://www.ebiomall.com/
| 建库试剂盒 | 产品编号 | 规格 | 价格(元) |
| Hieff NGSTM NanoDNALibraryPrepKitforIllumina® | 12202ES08 | 8libraries | 2456.00 |
| 12202ES24 | 24libraries | 6486.00 | |
| 12202ES96 | 96libraries | 23567.00 | |
| 建库模块 | 产品编号 | 规格 | 价格(元) |
| HieffNGSTM DNASelectionBeads(SuperiorAmpureXPalternative) | 12601ES03 | 1mL | 296.00 |
| 12601ES08 | 5mL | 986.00 | |
| 12601ES56 | 60mL | 6286.00 | |
| 12601ES75 | 450mL | 26186.00 | |
| HieffNGSTM EndRepairModule | 12605ES20 | 20T | 1466.00 |
| HieffNGSTM dA-TailingModule | 12606ES20 | 20T | 1766.00 |
| HieffNGSTM Fast-PaceDNALigationModule | 12607ES24 | 24T | 3266.00 |
| 12607ES96 | 96T | 10866.00 | |
| HieffNGSTM Fast-PaceEndRepair/dA-TailingModule | 12608ES24 | 24T | 2066.00 |
| 12608ES96 | 96T | 6166.00 | |
| HieffNGSTMFast-PaceDNAFragmentationReagent | 12609ES50T | 50T | 1466.00 |
| HieffNGSTM Single-IndexedAdapterKitforIllumina®,Set1 | 12611ES24 | 24T | 1166.00 |
| 12611ES96 | 96T | 4366.00 | |
| HieffNGSTM Single-IndexedAdapterKitforIllumina®,Set2 | 12612ES24 | 24T | 1166.00 |
| 12612ES96 | 96T | 4366.00 | |
| HieffNGSTM Dual-IndexedAdapterKitforIllumina® | 12614ES96 | 96T | 6566.00 |
| Hieff NGSTM CompleteAdapterKitforIllumina®,Set1 | 12615ES04 | 12×4T | 1256.00 |
| 12615ES16 | 12×16T | 4536.00 | |
| Hieff NGSTM CompleteAdapterKitforIllumina®,Set2 | 12616ES04 | 12×4T | 1256.00 |
| 12616ES16 | 12×16T | 4536.00 | |
| 2×SuperCanaceTM High-FidelityMix forLibraryAmplification | 12620ES03 | 1mL | 526.00 |
| 12620ES08 | 5×1mL | 1426.00 | |
| 文库定量 | 产品编号 | 规格 | 价格(元) |
| Hieff NGSTMLibraryQuantificationKitforIllumina®,qPCRMasterMix | 12302ES05 | 500T | 1526.00 |
| Hieff NGSTMLibraryQuantificationKitforIllumina®,DNAStandard(1-6) | 12307ES09 | 6×96μL | 2126.00 |
| PicogreendsDNAQuantitationReagent 双链DNA(dsDNA)定量试剂 | 10224ES01 | 100µL | 518.00 |
| 10224ES02 | 5×100µL | 2118.00 | |
| 10224ES03 | 10×100µL | 3848.00 | |
| 10224ES04 | 1×1mL | 3768.00 | |
| PicogreendsDNAAssayKit 双链DNA(dsDNA)定量检测试剂盒 | 10225ES84 | 2000T | 4238.00 |