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Hieff NGSTM MaxUp DNA Library Prep Kit for Illumina®

1、研发背景

快速精准建库产品,您用对了吗?   

DNA文库制备是高通量测序前期的核心环节,文库的产量与质量直接决定了测序数据的产量与质量。但目前市面上多数试剂盒的建库方法,耗时、昂贵且操作非常繁琐的。这些方法在性能方面也存在一定的缺陷:如仅适用于DNA量充足且品质较好的样本InputDNA片段化不完全、常出现形成G尾、聚合物等副反应或测序文库表现出一定的偏好性等。这些情况显著降低了DNA文库的转化率,并且极大影响后续测序数据的覆盖度和准确度。

Yeasen MaxUp,您的高通量测序建库的首选!   翊圣生物根据现状,集中海内外高通量测序领域的优秀科研人员,历时数年,开发了HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®常规DNA建库试剂盒,从产品设计,产品原料选用,产品性能优化,产品性能验证,产品标准制定,到产品成型,产品规模化生产,每一步都在严苛的标准、精细的研究中,实现了产品品质的飞跃。
HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®在文库产量与质量方面表现卓越:DNA的文库构建步骤少、转化率高,相对进口同款品牌至少高出20%,使文库扩增循环数更低,显著降低了测序数据的冗余度和偏好性。在建库速度、简便性、性价比以及样本适用性方面,达到国际一流品质。

2、产品描述   HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®是针对Illumina®高通量测序平台专业开发设计的建库试剂盒。本试剂盒可将低至1ng的微量片段化DNA制备成适用于Illumina®测序平台的专用文库。该试剂盒精心优化的配方体系,使他广泛适用于各种DNA样本。试剂盒整合了多个酶反应步骤,提供简并、线性化的操作方案,显著提高DNA建库效率。
HieffNGSTM产品具有严格的生产工艺,保证提供的每批次产品都经过严格的质量控制和功能验证,最高程度保障产品优异性能与批间稳定性。


1)2.75小时高效建库
HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®整合了多个酶反应步骤,提供简并的、线性化的操作方案,将DNA建库时间缩短至2.75小时以内。

图1HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®相对进口品牌N*同类型产品,建库更快。
2)文库转化率高
   文库转化率,即DNA片段转化为双端带特定接头DNA片段的效率,是衡量建库试剂盒效率的重要指标。文库转化率强烈影响文库的多样性和质量,文库转化率高在一定程度上意味着测序覆盖度更好。
 
图2HieffNGSTMMaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®相对进口品牌N同类型产品具有更高的文库转化率。
样本:片段化E.coligDNA。接头比例:按各款试剂盒中推荐的数值。测定方法:连接完整接头后,qPCR文库定量。
3)文库扩增循环数少
   获得特定产量文库所需的PCR循环数,是衡量试剂盒建库效率的另一重要指标。PCR循环数不足,可能造成文库产量低;PCR循环数过高,又将导致文库偏好性增加、冗余度增加、嵌合产物增加、扩增突变积累等多种不良后果。在获得相同产量文库时,使用的PCR循环数越少,表示试剂盒的建库效率更高。
表1HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®相对进口品牌N*同类型产品具有更高的建库效率。

4)优异的文库质量
使用HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®对100ngE.coli gDNA建库,所得文库均为单一条带,正态分布,无杂峰,片段大小符合测序要求

 
图3HieffNGSTMMaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®所建文库Agilent2100Bioanalyzer检测。
建库样本:片段化E.coli gDNA。双轮分选比例(Post-adapterLigation):0.6×/0.2×和0.55×/0.15×。

5)优秀测序数据
   测序数据是反映建库试剂盒性能的最重要指标。使用HieffNGSTMMaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®和N*Ultra品牌同类型产品用于大肠杆菌基因组DNA文库构建,并使用Illumina® Hiseq4000平台,以PE150模式进行测序。所得Q30、碱基质量,MappedReads以及Coverage等方面均与品牌N*Ultra同类型产品相当,表现优异。
表2大肠杆菌K12菌株基因组DNA测序数据统计。
InputDNA:100ng.IlluminaHiseq4000,PE150,referencegenome: Escherichiacolistr.K-12substr.MG1655.


InputDNAngNumberofcyclesrequiredtogenerate
100ng1000ng
YeasenMaxUp品牌N* YeasenMaxUp品牌N*
50001-23-43-4
1003-45-77-88-9
506-77-98-911-13
109-1011-1312-1314-16
112-14-16-17-


图4100ng_Yeasen样品测序数据Fastqc报告(左:序列质量分布;右:碱基分布)。
6)最优的性价比
Yeasen致力于为您提供性价比最高的产品!!
 
图5HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina®性价比更高。

3、产品应用:将1ng-1μg片段化DNA制备成适用于Illumina®测序平台的专用文库。

4、文献引用[1]HeadSR,KomoriHK,LaMereSA,etal.Libraryconstructionfornext-generationsequencing:overviewsandchallenges[J].Biotechniques,2014,56(2):61.
[2]ParkinsonNJ,MaslauS,FerneyhoughB,etal.Preparationofhigh-qualitynext-generationsequencinglibrariesfrompicogramquantitiesoftargetDNA[J].Genomeresearch,2012,22(1):125-133.
[3] vanDijkEL,JaszczyszynY,ThermesC.Librarypreparationmethodsfornext-generationsequencing:tonedownthebias[J].Experimentalcellresearch,2014,322(1):12-20.
[4]WolfK,O'NeilD,SchroeerS,etal.Next‐GenerationSequencingLibraryPreparationfromFFPETissueSamples[J].CurrentProtocolsinMolecularBIOLOGy,2016:7.24.1-7.24.14.
[5] AponeL,LiuP,PanchapakesaV,etal.EnhancingclinicalutilityofNGSwithreducedbias,lowDNAinput,libraryconstruction[J].2016.

5、常见问题Q:该款试剂盒适用于哪些样本的建库?
A:本试剂盒适用于所有样本的DNA建库。
Q:在使用该款试剂盒时,不同类型的样本的InputDNA量应为多少?
A:InputDNA特指投入末端修复/dA尾添加步骤中的DNA。下表列举了本试剂盒在常见应用中推荐的InputDNA量。
表1常见应用中推荐InputDNA量


ProductCleanReadsCleanBase(G)Q30(%)MappedReads(%)Coverage(%)AverageDepth(X)
Yeasen6,970,9361.06992.8692.2597.21187.34
N*Ultra6,667,8661.01891.8392.1196.92186.90

【注】:上表为使用高质量DNA时推荐的InputDNA量,当InputDNA质量较差或需要进行片段分选时,应适当上调使用量。


Q:文库制备过程中,是否需要片段长度分选?
A:文库制备过程中需要进行片段长度分选。分选步骤可选择在末端修复/dA尾添加之前,或在接头连接之后,或在文库扩增之后进行。当InputDNA质量≥50ng,您可选择在接头连接后分选;如InputDNA质量<50ng,建议您在文库扩增后进行分选。
Q:使用该款试剂盒所得的文库是否可以用于IonTorrent平台?
A:本款试剂盒针对Illumina®平台开发,所得文库仅适用于Illumina®平台。
Q:产品的有效期与保存方法?
A:产品所有组分-20°C保存,有效期1年。
Q:纯化和分选步骤,可以使用哪些磁珠
A:纯化和分选步骤,建议使用HieffNGSTM DNASelectionBeads(Cat#12601)或AMPureXPBeads(Cat#A63880)或其他等效产品。


6、订购信息

应用样本类型推荐InputDNA量
全基因组测序复杂基因组50ng-1μg
靶向捕获测序复杂基因组10ng-1μg
全基因组测序,靶向捕获测序FFPEDNA≥50ng
全基因组测序,靶向捕获测序cfDNA/ctDNA≥1ng
全基因组测序微生物基因组1ng-1μg
免疫共沉淀测序ChIP-DNA≥1ng
靶向测序扩增子≥1ng


7、相关产品推荐测序文库制备,您还可能用到

产品货号规格价格(元)
HieffNGSTM MaxUpDNALibraryPrepKitforIllumina12201ES088libraries1726.00
12201ES2424libraries4626.00
12201ES9696libraries16626.00

 
更多产品信息请拨打:4000-520-616或登陆:https://www.ebiomall.com/

建库试剂盒产品编号规格价格(元)
Hieff NGSTM NanoDNALibraryPrepKitforIllumina®12202ES088libraries2456.00
12202ES2424libraries6486.00
12202ES9696libraries23567.00
 
建库模块产品编号规格价格(元)
HieffNGSTM DNASelectionBeads(SuperiorAmpureXPalternative)12601ES031mL296.00
12601ES085mL986.00
12601ES5660mL6286.00
12601ES75450mL26186.00
HieffNGSTM EndRepairModule12605ES2020T1466.00
HieffNGSTM dA-TailingModule12606ES2020T1766.00
HieffNGSTM Fast-PaceDNALigationModule12607ES2424T3266.00
12607ES9696T10866.00
HieffNGSTM Fast-PaceEndRepair/dA-TailingModule12608ES2424T2066.00
12608ES9696T6166.00
HieffNGSTMFast-PaceDNAFragmentationReagent12609ES50T50T1466.00
HieffNGSTM Single-IndexedAdapterKitforIllumina®,Set112611ES2424T1166.00
12611ES9696T4366.00
HieffNGSTM Single-IndexedAdapterKitforIllumina®,Set212612ES2424T1166.00
12612ES9696T4366.00
HieffNGSTM Dual-IndexedAdapterKitforIllumina® 12614ES9696T6566.00
Hieff NGSTM CompleteAdapterKitforIllumina®,Set112615ES0412×4T1256.00
12615ES1612×16T4536.00
Hieff NGSTM CompleteAdapterKitforIllumina®,Set2 12616ES0412×4T1256.00
12616ES1612×16T4536.00
2×SuperCanaceTM High-FidelityMix forLibraryAmplification12620ES031mL526.00
12620ES085×1mL1426.00
    
文库定量产品编号规格价格(元)
Hieff NGSTMLibraryQuantificationKitforIllumina®,qPCRMasterMix12302ES05500T1526.00
Hieff NGSTMLibraryQuantificationKitforIllumina®,DNAStandard(1-6)12307ES096×96μL2126.00
PicogreendsDNAQuantitationReagent 双链DNA(dsDNA)定量试剂10224ES01100µL518.00
10224ES025×100µL2118.00
10224ES0310×100µL3848.00
10224ES041×1mL3768.00
PicogreendsDNAAssayKit 双链DNA(dsDNA)定量检测试剂盒10225ES842000T4238.00


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