Denovo FCS Express6使用指南流式数据分析入门篇(上)

1.打开软件

在开始菜单栏中单击软件（或者在桌面上双击FCSExpress6快捷方式）

2.版面介绍

以下绘图均是FCSexpress6的flow版本，试用版本为6plus版本，后者的功能更全，操作界面基本相似，略有不同。
 

如需要分析数据，点击右上角的Newlayout。会出现如下类似于microsoft的操作版面：
 

3.添加数据

打开数据文件夹，将数据文件(FCSorLMD格式)拖入页面空白处，松手。会出现下边的界面：
 

对话框会让您选择数据显示的方式，散点图，密度图，彩点图，等高线图，三维模拟图，峰图等等，在您希望的数据显示方式前边勾上复选框（示例中选中的彩点图），点击OK！如下图所示：

此时点击DataList按钮，会发现文件夹中的数据都被加载过来了，如下图所示：
 

选中彩点图后，您会发现，Data栏下边会有previous和next2个按钮，这2个按钮可以切换当前散点图的数据源，遵循的顺序就是DataList中的顺序。例如我们点击next，彩点图的数据源会切换由”blank.fcs”切换为”cd3.fcs”。
 

如果当前数据的绘图不符合您的需求，坐标轴的标签是可以在标签出左键单击改动的。如有进一步的改动需求，您可以选中图形，点击右键会出现一系列选项，点击”format”，基本的关于图形的编辑都在这里。

（如果是Divaexperiment或者是C6的数据，可以点击File-Openfrom-Import选择Divaexperiment或者是C6，然后再选择文件，以C6为例，如下图）

C6的实验数据分别用Denovo和C6仪器自带软件打开后的结果展示如下：
 

此时点开Data-Datalist,C6文件中的每个well的数据都被加载进来了。

4.圈门

在软件上方菜单栏中有一项是“Gate”，点击它，会出现可以画门的图形选项，圆形门，方形门，多边形门，自由门，十字门是针对散点图，等高线图，彩点图等等二维图型的，其中Marker是针对峰图等一维图型的，具体示例如下图：
 

圈门之后，若希望下一个图形只展示Gate1门内的数据，需要做这样一个简单的操作，左键点击Gate1门，拖住Gate1门，往页面空白处拖动并松手，新的图形便形成了，此时可以根据需求改动横纵坐标轴的参数，示例如下图所示：

如果您有进一步圈门的需求，您可以继续圈门，并使用拖放功能来实现新的图形只展示目标门中的数据。另外门与门之间的逻辑图可以点击”Insert”——“GateView”，然后在空白版面出画出。

5.坐标轴标签的改动

如果您采集数据的时候并没有命名细胞marker和荧光素的关系，您可以在软件中设置。步骤如下图：
 

以上五步做完之后，按照下图继续设置：

如果您有多个marker，您需要继续点击Add按钮添加，全部添加完成后如下图所示：

然后点击右下角的OK。

Parameterlables编辑成功之后如何应用到绘图上呢？选中待改变坐标的绘图，点击菜单栏的Format,点击Axes，如下图所示：

标签就可以应用过来了，应用前后如下图：
 

本期的介绍先到这里啦，是不是等不及去试试拖放功能呢？下期会为大家介绍补偿的调节和应用，实验数据统计以及一些实用的小技巧。感兴趣的可以保持关注哦！

视频百度网盘链接：

链接:https://pan.baidu.com/s/1pLsU8Ld密码:2a84（软件的中文视频是FCSexpress4的，数据导入等基本操作和FCSExpress6试用版一致）