引用回帖:2楼: Originally posted by 西瓜 at 2013-05-23 16:43:56 如果你可以把基因组序列下载回来，可以用Vector NTI的motif分析来做。 貌似没有mismatch的选项，不过可以设置相似度，相似度越低得到的结果越多。 也可以把你的结合序列添加成一个“内切酶”，用酶切位点分析 ... （1）A genome-wide search using the genome sequence of S. aureus COL revealed the presence of 461 motifs up to 400 bp upstream of predicted genes: 16 motifs without a mismatch, 25 motifs with one mismatch, and 420 motifs with two mismatches (data not shown).To 。。。。 （2）It is also worth noting that when using the consensus sequence to do a whole genome search allowing two or three mismatches, many more putative Rex-binding sites could be identified in intergenic regions and upstream of genes that 。。。 好多文献都是这样讲的，软件都没提到？！ 2013年5月23日如何》在全基因组中搜索 转录因子的binding site ? 分子生物 综合其他 小木虫 论坛如何》在全基因组中搜索 转录因子的binding site ？ 分子生物 综合其他 小木虫 论坛如何》在全基因组中搜索 转录因子的binding site ？ 分子生物 综合其他 小木虫 论坛如何》在全基因组中搜索 转录因子的binding site ？
