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BioNano genomics光学图谱技术平台及原理 | 百迈客生物基因

Saphyr 半导体芯片上有多达120,000个纳米通道,经高清CCD对所有纳米通道的DNA实时成像,每个flowcell可采集高达5T数据,软件自动将图片数据转换成分子数据,最终组装得到全基因组光学图谱。

(1)基因组组装纠错

光学图谱可以对Nanopore或PacBio测序拼接的Contig序列进行排序和定位,明确片段之间的gap大小,同时识别与纠正Contig组装中潜在的错误连接,甚至可实现染色体水平组装。

Hi-C技术可基于核内染色质交联频率的统计方法将Contig连接到染色体长度的Scaffold上。在Contig排序和定向上仍存在一定错误。Bionano光学图谱可以帮助识别并纠正这些错误。


2020年8月11日BioNano genomics基因组单分子光学图谱是来源于单个DNA分子有序的全基因组限制性内切酶酶切位点图谱。能提供宏观的框架支持,反应整个基因组的结构信息。 BioNano全新...bionano genomics,光学图谱测序BioNano genomics基因组单分子光学图谱是来源于单个DNA分子有序的全基因组限制性内切酶酶切位点图谱。能提供宏观的框架支持,反应整个基因组的结构信息。 BioNano全新的标记技术Direct Label and Stain(DLS),无需对基因组DNA进行酶切BioNano genomics

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