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Affymetrix芯片平台GeneTitan系统介绍

服务名称: Affymetrix芯片平台GeneTitan系统介绍

Affymetrix芯片平台GeneTitan系统介绍

 GeneTitan系统

  Affymetrix GeneTitan系统是全自动高度集成的芯片工作站,使用类似于96孔板形式的芯片板,其中每一块方形芯片大约占据了96孔板一个孔的面积,一块芯片板可包含16,24或96块芯片,从而实现多样本高通量检测。GeneTitan系统非常适合于需要进行多样品高通量检测的情形,例如大量样品的GWAS研究,可以有效地控制检测成本。

平台设备
  Affymetrix GeneTitan系统是全自动高度集成的芯片工作站,该系统将从杂交到扫描的实验全过程中用到的杂交炉、流体工作站和CCD扫描成像设备整合为一台仪器,使用类似于96孔板形式的芯片板,将芯片板放入GeneTitan系统后,芯片的杂交、洗涤、扫描几乎无需人工干预,全部可以由机器自动完成。


 

检测原理
  以Axiom基因分型芯片检测为例,图示如下。表达谱芯片检测与GeneChip系统相同。

技术优势
 

高通量多样本检测:有16、24、96三种规格芯片,满足中等到高通量多种需求。

快速、自动化检测:实现从杂交到扫描的全自动芯片处理;缩短手工操作时间:手工操作时间缩减为30分钟;扫描一张芯片时间少于5分钟。
重复性高:全自动操作,减少了杂交、洗涤和扫描中的人为误差。

产品列表 
 

物种 芯片类型 产品编号 产品名称 数据库来源 探针或检测转录本数量
全基因组基因分型芯片 AFF-901764 AxiomTMGenome-Wide CHB1 Array Plate 来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库 640,673
  AxiomTMGenome-Wide CHB1&2 Array Plate (2张芯片/set) 来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库 1,296,521
AFF-901640 AxiomTMGenome-Wide ASI 1 Array Plate 来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库 600,307
3‘端表达谱芯片 AFF-901433 GeneChip HT HG-U133+ PM 16-Array Plate >54,000个探针组主要来源于UniGene database (Build 133, 2001年4月20日)和NCBI human genome assembly (Build 31). 与GeneChip Human U133 Plus 2.0 cartridge芯片完全相同,检测~38,500个注释完好的基因的~47,000个转录本
AFF-901261 GeneChip HT HG-U133+ PM 24-Array Plate
AFF-901262 GeneChip HT HG-U133+ PM 96-Array Plate
AFF-901605 Human Genome U219 16-array plate >530,000个探针组来源于UniGene database 219(2009年3月30日)、RefSeq version36(2009年7月13日)以及GenBank中的全长人类mRNA(2009年5月12日)。 检测约20,000个功能确定、有完整注释基因的~36,000个转录本,包含检测功能预测序列的1000个探针
AFF-901604 Human Genome U219 24-array plate
AFF-901595 Human Genome U219 96-array plate
小鼠 3‘端表达谱芯片 AFF-901434 GeneChip HT MG-430 PM 16-Array Plate >45,000个探针组主要来源于UniGene database(Build 107, 2002年6月)和MGSC(2002年4月) 与GeneChip Mouse 430 2.0 cartridge芯片完全相同,检测~34,000个注释完好的基因的~39,000个转录本
AFF-901257 GeneChip HT MG-430 PM 24-Array Plate
AFF-901258 GeneChip HT MG-430 PM 96-Array Plate Kit
大鼠 3‘端表达谱芯片 AFF-901435 GeneChip HT RG-230 PM 16-Array Plate >31,000个探针组主要来源于UniGene database (Build 107, 2002年6月)和MGSC (2002年4月) 与GeneChip Rat 230 2.0 cartridge芯片完全相同,检测约28,700个注释完好的基因的~31,000个转录本
AFF-901259 GeneChip HT RG-230 PM 24-Array Plate Kit
AFF-901260 GeneChip HT RG-230 PM 96-Array Plate
 

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