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【求助】微卫星长度多态性分析

我的PCR产物长度在170bp左右,我不知道杂合子两条带相差多少bp,我想问用琼脂糖可以跑出来了,用BMA公司的琼脂糖是不是好一些?谢谢各位老师!!

str是几重复的建议用page胶170太短了要是差2-5各碱基很难分开

STR用于遗传分析的,重复序列都是几个bp的,一般电泳是无法区分的。

用3.5%的琼脂糖 绝对分得开 。我区分14bp的片段用的此法 高效 高通量我本人在可能情况下绝对不推荐用非变性的 PAGE 费时费事具体如下:1你可以称量3.2g左右的aga ,因为加热时候会有水分的损失,可以保证达到3.5%;用TBE浸泡半个小时左右 目的是是更好的溶解和煮大于3%的aga都可以用此法;2 常规煮胶3 倒胶的时候很有诀窍:先插梳子和后查梳子 一般区分小片段和总长度小的片段可以先倒胶,然后插梳子;例如我做SNP的时候 没有酶切之前是140bp切完了是121和19bp,我选择先倒胶后查梳子,避免电泳的时候因为梳孔的形成对条带的影响 可以避免条带的扭曲;4 我使用是西班牙的biowest的琼脂糖;另外还推荐一种分子遗传学级别的琼脂糖 NuSieve,分辨率可以达到你的要求琼脂糖的效率远高于PAGE,建议大家分辩小片段和打样本量的时候,不要轻易用PAGE,会搞死人的。


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