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尊敬的客户，您好！
为了给客户提供更便捷的技术服务，创腾科技将会定期推出应用案例，供大家参考学习！
9月份共新增9个应用案例：
一、B-Raf激酶抑制剂构效关系的研究
二、Capsazepine衍生物的QSAR、对接和ADMET研究
三、超氧化物歧化酶热稳定性设计
四、Eya2磷酸酶选择性抑制剂作用机制的研究
五、VEGFR2电化学监控传感器的设计
六、使用Synthia模块建立聚合物内聚能预测模型并基于实验数据对模型进行拓展
七、AEP9新功能——化合物可合成性评分SAscore
八、通过基于配体的筛选方法获得晚期黑色素瘤抑制剂
九、上市药物分子中的2D和3D环片段的分析与研究
具体案例简介及查看链接：
| 案例名称 | B-Raf激酶抑制剂构效关系的研究 |
| 参考文献 | Ref：May2014|Volume9|Issue5|e95702IF=3.534 |
| 软件 | DiscoveryStudio |
| 研究方向 | 药物设计 |
| 简介 | B-Raf激酶是目前抗肿瘤药物研究的重要靶点之一，本文合成了一系列新型B-Raf激酶抑制剂，并采用分子对接和3D-QSAR模拟技术研究了该系列化合物同B-Raf激酶的作用模式和构效关系。 |
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| 案例名称 | Capsazepine衍生物的QSAR、对接和ADMET研究 |
| 参考文献 | Ref：July2014|Volume9|Issue7|e100797IF=3.534 |
| 软件 | DiscoveryStudio |
| 研究方向 | 药物设计 |
| 简介 | 辣椒素拮抗剂Capsazepine被发现具有免疫调节功能和抗炎活性，因此是一个用于开发有效且安全的抗炎药物的有利目标。基于Capsazepine及其衍生物，文章联合采用2D-QSAR、分子对接、ADMET预测、类药性预测和体外实验为发现更有效的抗炎和免疫调节药物提供指导。 |
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| 案例名称 | 超氧化物歧化酶热稳定性设计 |
| 参考文献 | ref:NatureStructural&MolecularBiology,Volume19,Number10,October2012.IF=11.902 |
| 软件 | DiscoveryStudio |
| 研究方向 | 抗体工程 |
| 简介 | 超氧化物歧化酶（SOD）能消除生物体在新陈代谢过程中产生的有害物质，对人体不断补充SOD具有抗衰老的特殊效果。本文从植物中提取了一种SOD酶，并对其热稳定性进行了设计和改造，设计得到稳定性更高的超氧化物歧化酶。 |
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| 案例名称 | Eya2磷酸酶选择性抑制剂作用机制的研究 |
| 参考文献 | ref：journalofbiologicalchemistry,june6,2014.volume289.number23IF=4.6 |
| 软件 | DiscoveryStudio |
| 研究方向 | 药物设计 |
| 简介 | Eya蛋白是控制转录的辅助因子，Eya磷酸酶调控乳腺癌的生成和转移，是治疗乳腺癌新的靶标。本文采用新型抑制剂特异性的作用Eya2，并且通过分子对接发现，新型抑制剂属于别构抑制剂。 |
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| 案例名称 | VEGFR2电化学监控传感器的设计 |
| 参考文献 | ref：ScientificReports，2014.3.5，IF=5.078 |
| 软件 | DiscoveryStudio |
| 研究方向 | 药物设计 |
| 简介 | 血管内皮生长因子受体2（VEGFR2）与炎症、肿瘤等疾病发生有关，监控VEGFR2的表达，临床上可以检测肿瘤等疾病。本文利用电化学的方法设计VEGFR2监控传感器，然后采用已知抑制剂Sorafenib、Vandetanib进行检测，采用分子对接技术对检测结果进行解释。 |
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| 案例名称 | 使用Synthia模块建立聚合物内聚能预测模型并基于实验数据对模型进行拓展 |
| 参考文献 | Bicerano,J.PredictionofPolymerProperties,ThirdEdition,MarcelDekkerInc.:NewYork(2002). |
| 软件 | PipelinePilot |
| 研究方向 | 化学信息学 |
| 简介 | 化学文献中经常包含大量的化学名称，将这些化合物从文献中提取出来并转换成各种软件能够识别的化合物结构是一件很麻烦的事情。本文将通过PipelinePilot，通过自动识别化学文献中的化学名，并批量地将这些名称转换成化学结构。 |
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| 案例名称 | AEP9新功能——化合物可合成性评分Sascore |
| 参考文献 | PeterErtl,AnsgarSchuffenhauer,"Estimationofsyntheticaccessibilityscoreofdrug-likemoleculesbasedonmolecularcomplexityandfragmentcontributions",J.Cheminformatics,2009,1:8. |
| 软件 | PipelinePilot |
| 研究方向 | 化学信息学 |
| 简介 | 药物设计及虚拟筛选过程中常常会得到大量的虚拟化合物。尽管这些化合物具有很高的预测活性，然而要将它们通过化学方法合成成实际的化合物时却经常碰到很多困难，大量的虚拟化合物无法合成或者合成成本很高。这样无疑会给药物设计者与药物合成人员的沟通上增添很多障碍，降低工作效率，同时也容易引起化学合成科研人员的不信任。 |
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| 案例名称 | 通过基于配体的筛选方法获得晚期黑色素瘤抑制剂 |
| 参考文献 | - |
| 软件 | PipelinePilot |
| 研究方向 | 药物设计 |
| 简介 | 作者新发现了一个高活性的黑色素瘤抑制剂，为了获得更多的化合物进行构效关系研究，以及得到更多的潜在骨架结构，作者使用PipelinePilot的相似性搜索等基于配体的虚拟筛选方法获得了一系列全新的活性化合物。 |
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| 案例名称 | 上市药物分子中的2D和3D环片段的分析与研究 |
| 参考文献 | ChemBiolDrugDes2014;83:450–461 |
| 软件 | PipelinePilot |
| 研究方向 | 化学信息学 |
| 简介 | 已知，在基于片段的药物设计和先导化合物优化研究中，以小体积的平面芳香环作为分子片段的重要组成是一种通用的操作方式。随着全新化学和生物空间的探索研究，以及化合物合成技术的发展，3D分子片段越来越受到研究者的关注。本文使用多种化学信息学研究工具（包括PipelinePilot）和算法对上市药物分子的2D和3D环片段进行了详细分析与研究。结果表明，3D环片段系统表现了高度的结构和形状多样性，并且与2D环系统的差异明显，而这些性质可能对化合物的生物活性密切相关。 |
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