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biossusa不同样品的加载控制选择

正在研究各种各样的蛋白质。帮助选择加载控件,常用 加载控件 来自细胞质,线粒体和细胞核的蛋白质的分析见下文。


细胞质蛋白 

肌动蛋白

在蛋白质印迹分析中,α和β肌动蛋白均已用作上样对照。但是,在选择肌动蛋白作为负载对照之前,应确保它是一个适当的对照,各治疗组之间差异很小甚至没有差异。细胞生长条件的变化确实会破坏肌动蛋白的合成。此外,

鉴于肌动蛋白蛋白倾向于以很高的浓度存在于细胞中,因此必须确保其动态检测范围,避免信号饱和和肌动蛋白蛋白水平变化。

 

甘油醛3-磷酸脱氢酶 (GAPDH,G3PD,GAPD)

GAPDH是一种结合RNA的管家蛋白,在整个物种中高度保守。值得注意的是,一项综合研究表明,GAPDH mRNA水平在不同组织类型之间存在显着差异,但在年龄和性别方面保持不变。因此,在使用相同类型组织的分析中,这是有用的加载控制。在其他情况下,例如在两种不同类型的组织之间进行分析,GAPDH并不是可靠的控制方法。

 

小管蛋白

存在五种微管蛋白(α,β,γ,δ和ε),并且在整个物种中高度保守。其中,α-,β-和γ-微管蛋白已被用作上样对照。由于微管蛋白广泛参与细胞增殖,因此许多化学物质可影响体内的微管蛋白表达  

 

文库林

Vinculin是用作Western印迹上样对照的另一种细胞骨架蛋白。它是细胞-细胞和细胞-基质连接的主要成分之一。由于其体积大,所以将vinculins用作高分子量蛋白质的上样对照。

2-1

核蛋白

拉明斯

核纤层蛋白是核纤层蛋白的结构成分,它们支持核被膜,并参与细胞周期中核被膜的分解和重新形成。在动物细胞中,三个基因编码三种类型的至少七个lamin。胃泌尿后表达A型lamins,C型lamins的表达是组织特异性的,而B型lamins存在于每个细胞中。在lamin中,Lamin B1在整个物种中都是保守的,通常用作核蛋白研究的负载对照。值得注意的是,Lamin B1蛋白不适合作为无核被膜样品的上样对照。

 

TATA盒结合蛋白(TBP)

TATA盒存在于10-20%的人类基因启动子中。TBP是高度保守的通用转录因子,在通过RNA聚合酶II进行基因转录之前,它与TATA box DNA序列特异性结合。翻译后修饰可能会导致蛋白质印迹上TBP分子量的微小变化。 

 

增殖细胞核抗原(PCNA)

PCNA参与真核DNA复制。它是DNA聚合酶δ的辅因子,在细胞周期的S期期间在细胞核中表达。PCNA在从酵母到灵长类动物的物种中高度保守。但是,由于PCNA的功能是DNA复制,因此对于非增殖细胞或经过抗增殖处理的细胞,PCNA的负荷控制很差。

 

线粒体蛋白

VDAC1 / porin

电压依赖性阴离子通道(VDCA)是一类孔蛋白家族蛋白,是真核细胞中线粒体外膜的主要蛋白。在脊椎动物的三个成员(VDAC1,VDAC2和VDAC3)中,VDAC1在许多物种中都是保守的,并存在于线粒体外膜中。它在心脏,肝脏和肌肉组织中表达。由于存在可变剪接,因此存在VDAC1的多个变体。

 

细胞色素C氧化酶/ COX4I1

线粒体内膜中的细胞色素C氧化酶是线粒体电子传输链的最后一个酶复合物。该复合物由线粒体和核基因编码的13个亚基组成。细胞色素C氧化酶的亚基IV具有两个同工型(同工型1和2),由两个核基因(COX4I1和COX4I2)编码。亚型1在肺组织中普遍表达,而亚型2在肺组织中高度表达。Isoform I COX4I1通常用作加载控件。



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biossusa如何为Western Blot选择加载控件?

蛋白质印迹是蛋白质检测和定量的黄金标准,因此广泛用于生物学研究。鉴于蛋白质印迹法多个步骤组成,过程中的任何潜在变化(例如样品制备,样品加载或蛋白质转移到膜等)都可能导致截然不同的结论。为了避免由潜在的性能差异引起的误解,在任何蛋白质印迹测定中必须建立适当的上样对照。

 图片3-1

蛋白质印迹的最常见应用可能是研究生物学样品中蛋白质丰度的变化对照蛋白和实验蛋白的抗体被应用于同一印迹,并且来自加载控件将用于归一化目标蛋白的信号。因此,理想的上样控制应该是在目标样品中以稳定水平表达的蛋白质由于这个原因,被普遍表达且对于基本细胞功能必需的管家蛋白,例如细胞骨架蛋白,被认为是出色的上样对照,并被广泛使用。然而,细胞骨架蛋白被无差别地用作“通用”的加载控制。已经表明,尽管细胞骨架蛋白在细胞中组成性表达,但它们的表达水平可响应于特定的实验条件而变化。

图2-2

而不是随机选择 β-肌动蛋白 要么 α-管蛋白作为上样对照,仔细寻找合适的对照蛋白不仅是关键的关键因素,而且对于特定的蛋白质印迹而言也至关重要。各种不同的蛋白质的可在特定的实验中为用作上样对照,只要它们的表达水平是稳定的,相对独立的用在感兴趣样品实验蛋白质表达。为了使选择更加简单,我们在此列出研究人员的一般注意事项。下一个博客将讨论针对特定实验的更详细标准

 

要考虑的一般标准:

  • 稳定的表达:与总蛋白相比,上样对照的蛋白水平应保持恒定,并且不受测试变量(例如化验处理或发育阶段)的影响,

  • 检测大小:上样对照的分子量应与目标蛋白质的分子量实质不同。

  • 表达水平:选择一个在目的样品中表现出强表达的上样对照。

  • 丰度可比性:对照蛋白质的丰度应与样品中目标蛋白质的丰度相当。即,该方案和检测方法可以揭示上样对照和目的蛋白水平的变化,而不会产生信号饱和。(如果上样对照的表达水平大大高于目的蛋白的表达水平,则必须进行专门用于连续稀释的蛋白对照的蛋白质印迹,以确定上样对照的检测范围。)



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