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Rubicon Genomics, Inc. 是开发和应用有效方法来分析人类 DNA 以进行全基因组基因分型和单倍型分析的领导者。该公司正在开发其专有的 OmniPlex TM技术作为一个集成平台,用于存档、扩增和分析患者 DNA,用于药物靶点发现、药物基因组学和诊断。可以使用已存档为 OmniPlex DNA 的小 DNA 样本进行单位点、多位点或全基因组扩增。Rubicon 技术将使全基因组 SNP 评分更快、更准确、更可靠且成本更低。Rubicon 将与制药和诊断公司以及仪器和试剂制造商合作,将 OmniPlex 技术推向最广泛的市场——增加更有效和更安全药物的管道,并引入基于基因的医学实践。
Rubicon Genomics公司使用技术PicoPLEX开发了*款构建一个高度可重复的单细胞全基因组文库扩增试剂盒:PicoPLEX WGA Kit ,该单细胞全基因组扩增试剂盒是目前世界上先进的单细胞全基因组扩增技术。
PicoPLEX相比于以往的MALBC、PCR和MDA为基础的单细胞全基因组扩增技术,操作更加简单快速。
PicoPLEX同样应用于拷贝数变异分析-CNV(aCGH)、单核苷酸多态性分型-SNP和基因突变筛查-PCR等,尤其适合用于单细胞染色体异倍性分析和拷贝数变异分析,是胚胎植入前基因筛查(PGS)胚细胞WGA的金标准。
PicoPLEX与MALBAC的区别
PicoPLEX技术与MALBAC相比,结果更准确、重复性更高,更适合用于单细胞染色体异倍性分析和拷贝数变异分析。
PicoPLEX单细胞技术比MALBAC更早
申请情况
Rubicon PicoPLEX: US8206913 Filed Date : Mar 3, 2010
MALBAC : WO2012/166425 International filing date : 22 May, 2012
主要区别
(1)MALBAC的细胞裂解时间更长。
MALBAC:30 min
PicoPLEX:15 min
(2)引物设计不同,PicoPLEX的结果更准确、重复性更高,更适合用于染色体异倍性分析和拷贝数变异分析。
参考文献:
The comparison of the performance of four whole genome amplification kits on ion proton platform in copy number variation detection.Zhang X1, et al.Biosci Rep. 2017 Jul 7.
>>>四种商业WGA试剂盒(包括MALBAC)比较结果:Rubicon的PicoPLEX 具有较高质量、保真性和可重复性,并且具有zui高一致性。
PicoPLEX技术优势
1-10个细胞或 6 pg-60 pg纯化gDNA
适用于温和固定细胞
生成足够量的基因组样品用于qPCR,芯片和NGS分析。
可靠、可重复的解决方案,适用于单细胞染色体非整倍性分析和拷贝数变异分析。
胚胎植入前基因筛查(PGS)胚细胞WGA金标准。被世界范围内的PGS系统和服务机构广泛使用。
植入前基因筛查和诊断(PGS,PGD)是指体外受精(IVF)过程中所做的胚胎或卵母细胞测试,以便选择没有染色体变异和家族遗传病等位基因的胚胎,提高怀孕成功率,减少特定遗传病的传递风险。微阵列分析是IVF机构zui常用的PGS技术,这类试剂盒有好几种都嵌合了PicoPLEX技术,被广泛使用。包括Illumina’s 24Sure 微阵列, Perkin Elmer’s KaryoLite BoBs developed for PGS和 Oxford Gene Technology’s CytoSure™ 微阵列。
Rubicon R400406 测序文库 DNA检测
Rubicon拥有ThruPLEX®和PicoPLEX®技术。特殊的引物或接头设计,能以微量DNA样本起始构建下一代测序文库。
ThruPLEX
Rubicon ThruPLEX和所有illumina NGS平台兼容。ThruPLEX DNA-seq Kit是通用性较高的试剂盒,适合全基因组测序、全外显子测序、靶向测序和ChIP-Seq的文库构建。
ThruPLEX Plasma-seq是血浆游离DNA的试剂盒,适用液体活检相关(循环肿瘤DNA和*产前检测:母体血浆胎儿游离DNA)的基因文库构建。
ThruPLEX Tag-seq Kit能提供1600万以上的分子标签(Unique Molecular Tags),结合靶向序列富集系统,适合稀有变异等位基因检测。
PicoPLEX
Rubicon PicoPLEX 采用技术,设计优化用于从单细胞中扩增全基因组DNA,适用植入前胚胎基因筛查和诊断(PGS,PGD)。
PicoPLEX WGA Kit不能直接应用NGS,PicoPLEX DNA-seq Kit可以直接应用illumina NGS平台。
Rubicon ThruPLEX®和PicoPLEX®两种技术都有独特的自配对茎环形DNA fragment,能减少基因扩增时假阳性、假阴性和非特异性扩增的发生。
苏州蚂蚁淘生物科技有限公司是一家经营医药标准品、化工环境标准品、高端试剂的专业公司,是全球领先科研方案的专业供应商。
自成立以来,公司坚持以“保障客户利益是我们的第一追求”为经营宗旨,发展成为全球多个高端标准品公司国内总代理和授权代理商,能提供超过100000种的有机和无机标准品或试剂,产品涉及药企,科研单位,检测机构,工厂实验室和高校等绝大部分科研单位;同时提供优质的咨询服务,实力雄厚。
公司以代理经营为主,代理20多个国外知名品牌的标准品、对照品,高端化学试剂,包括欧标EP,欧盟IRMM,日标JP,印度标IP,加拿大TRC,TLC,MC,英国BP,LGC,NIBSC,美国NIST,ChromaDex,美国Zyagen,挪威Chiron等。