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苏州蚂蚁淘生物科技有限公司
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Sage Science 很高兴与 Universal Sequencing Technology 联手推广他们的TELL-Seq 条形码链接读取技术。我们兴奋的原因之一是 TELL-Seq 和基于转座酶的条形码方法极大地受益于高分子量 DNA——Sage 的专业领域之一。我们自己的HLS-CATCH方法是一个特别适合 TELL-Seq 的领域,特别是考虑到 HMW 目标纯化产生的 DNA 量相对较少。简单的文库工作流程和可随时访问 Illumina 测序也是一大优势。
验证这个命题简单明了。我们使用来自 Bottle Ashkenazi trio 样本集的 Genome 培养细胞执行 HLS-CATCH,使用 Cas9 指南,我们设计用于纯化包含 BRCA2 基因座的 187kb 目标。TELL-seq 文库是从每个人的目标制备的,测序并通过 10X Genomic 的 Long Ranger 分析包运行,然后在 10X Loupe 浏览器上可视化数据。相位块大小分别为 186 kb(母)、181kb(子)和 168Kb(父),只需要进行小基因组规模分析。
6 个单倍型中的变体与瓶中基因组高质量序列相比具有优势。
显然,CATCH 和 TELL-seq 可以成为获得基因靶标的远程基因组数据的经济替代方案。这种技术的价值之前在斯坦福大学的一篇论文 (Shin, GW, et al. 2019) 中得到了证明,其中,除其他分析外,4Mb MHC 组织相容性复合物使用 10X Genomics 链接读取方法进行定相。与长读长测序文库所需的工作相比,TELL-Seq 的简单性是个好消息。然而,那里也正在取得进展。最近的两篇论文展示了使用 HLS-CATCH 和 PacBio 测序(Walsh, T. et al. 2020)和 Oxford Nanopore(Zhou, B, et al. 2020)取得了很好的结果。
苏州蚂蚁淘生物科技有限公司是一家经营医药标准品、化工环境标准品、高端试剂的专业公司,是全球领先科研方案的专业供应商。 自成立以来,公司坚持以“保障客户利益是我们的第一追求”为经营宗旨,发展成为全球多个高端标准品公司国内总代理和授权代理商,能提供超过100000种的有机和无机标准品或试剂,产品涉及药企,科研单位,检测机构,工厂实验室和高校等绝大部分科研单位;同时提供优质的咨询服务,实力雄厚。 公司以代理经营为主,代理20多个国外知名品牌的标准品、对照品,高端化学试剂,包括欧标EP,欧盟IRMM,日标JP,印度标IP,加拿大TRC,TLC,MC,英国BP,LGC,NIBSC,美国NIST,ChromaDex,美国Zyagen,挪威Chiron等。
Sage Science PippinHT一次运行最多选择 24 个样品PippinHT 采用了该公司备受推崇的上浆技术,并将吞吐量提高到每次运行 24 个样品,而 Pippin Prep 或 BluePippin 最多只能处理 5 个样品。该仪器为运行繁忙的测序实验室、核心设施和其他产生大规模测序数据的实验室的科学家提供了一种高效、自动化的解决方案。PippinHT 系统的优势样本间的重现性简化了研究更高的样品质量改进了下游分析24 个样本容量满足高通量测序需求关键下游技术全基因组测序miRNA文库分离